Trois mois ont passé depuis qu'Angel et Cordelia ont disparu sans laisser de traces. Gunn et Fred font ce qu'ils peuvent pour continuer à faire marcher l'agence, tout en faisant des recherches pour essayer de trouver Angel. Connor vit à l'hôtel avec eux et nul ne sait qu'il est responsable de la disparition de son père. Angel toujours coincé dans son cercueil au fond de l'océan, subit de terribles hallucinations causées par la faim. Wesley réussit à faire parler Justine et grâce à son aide parvient à retrouver l'endroit où le cercueil a été jeté, il le remonte et délivre Angel. Peu après, celui-ci se trouve enfin confronter à son fils.

2)"Ground State"

Angel est à la recherche de Cordelia. Mais pour la retrouver, il doit dérober l'Axis, un objet mystique qui possède le pouvoir de retrouver des entités à travers les dimensions. Malheureusement, l'Axis est volé sous les yeux d'Angel qui ne peut rien faire, par Gwen une jeune femme possédant d'étranges pouvoirs électriques. La relation intime entre Wesley et Lilah continue même si celle-ci est dorénavant celle qui dirige Wolfram & Hart. Connor, jeté à la rue par son père, survit seul comme il le peut.

3)"The House Always Wins "

Angel surveille de loin Connor. Veillant sur lui dans l'ombre. Il décide d'emmener Gunn et Fred à Las Vegas afin d'aller voir Lorne. A leur grande surprise, celui-ci est la vedette principale d'un grand casino, où il fait chaque soir un malheur. Fred et Gunn découvrent vite que Lorne y est retenu prisonnier par le patron du lieu qui se sert des fabuleux pouvoirs de divination du démon afin de voler la destinée de certaines personnes et de les revendre aux enchères. Angel lui aussi en fera les frais.

4)"Slouching Toward Bethlehem"

De retour à Los Angeles, Angel, Fred et Gunn découvrent avec stupéfaction que Cordelia est de retour mais Angel déchante vite lorsqu'il se rend compte que Cordy est amnésique et ne se souvient absolument pas d'eux. Pour ménager la jeune femme, ils décident de lui mentir et ne lui révèlent pas la vraie nature d'Angel ni le monde démoniaque dans lequel ils vivent, mais Cordelia qui se méfient d'eux finit par tout apprendre et déçue par leur manque de sincérité, décide d'aller vivre avec Connor. Pour comprendre la raison pour laquelle les Pouvoirs Supérieurs ont renvoyé sur terre Cordelia, Lorne lit dans son esprit et ce qu'il y apprend, le terrifie tellement qu'il refuse d'aller plus loin.

5)"Supersymmetry"

Fred apprend avec fierté, que l'article qu'elle a écrit "Supersymmétrie et Sous-espace P-Dimensionnel" a été publié dans un célèbre magazine et qu'elle est invitée à donner une conférence. La conférence est interrompue par un horrible démon surgit par l'ouverture d'un portail dimensionnel, rouvrant du même coup, toutes les peurs enfouies de la jeune femme. Cette peur va se changer en haine, lorsque Fred découvrira que c'est son ex-professeur de physique qui est responsable de son séjour à Pylea. Fred ne songe alors qu'à se venger bien que Gunn essaie de l'en dissuader, ce qui va commencer à créer des dissenssions entre eux.

6)"Spin The Bottle"

Après avoir échangé un baiser avec Connor, Cordelia qui s'est rendue compte des sentiments pas vraiment filiaux du jeune garçon envers elle, décide de retourner à l'hôtel. Elle se pose beaucoup de questions sur ses propres sentiments envers Angel. Lorne leur propose de jeter un sort afin que les souvenirs de Cordelia reviennent. Angel n'est pas très enthousiaste mais finit par accepter car le démon lui promet que ce sort est sans fâcheuse conséquence. Tout le monde est là même Wesley dont la présence était indispensable. Le sort est lancé grâce à une bouteille magique mais n'a pas les conséquences prévues, chacun reprend sa personnalité d'adolescent sauf Lorne qui se retrouve éjecté, inconscient, derrière le comptoir. Angel redevient Liam sans savoir qu'il est dorénavant un vampire, Cordelia la peste qu'elle était, Wesley le jeune anglais imbu et trouillard, Gunn le jeune chef de gang et Fred la jeune fille introvertie et timide.

7)"Rain of the Fire" (Apocalypse, Nowish)

Le sort a finalement marché et Cordelia a retrouvé ses souvenirs, les bons et les mauvais. Elle est bouleversée et repousse Angel malgré le fait qu'elle lui ai enfin avoué qu'elle était amoureuse de lui, car ayant atteint une dimension supérieure, elle a revécut et ressenti toutes les souffrances et toutes les horreurs qu'a pu commettre Angelus. Pour se donner du temps elle retourne vivre auprès de Connor. Mais tous devront bientôt faire face à un problème beaucoup plus important que leurs problèmes sentimentaux, le plus terrible et peut-être le dernier pour la race humaine, l'Apocalypse Finale amené par un démon surnommé La Bête.

8)"Habeas Corpses"

Le premier affrontement contre La Bête, un démon venu du fin fond des enfers, et Angel et son équipe s'est mal déroulé. Le démon semble invincible et tout le groupe s'en sort avec pas mal de blessures mais la pire pour Angel ne semble pas physique mais morale. Angel a vu son fils et Cordelia faire l'amour. Terriblement blessé, Angel se renferme de nouveau sur lui-même. La Bête massacre tous les employés de Wolfram & Hart. Lilah est sauvée in-extrémis par Wesley. Lorsqu'Angel, Fred, Gunn et Wesley retourne au Cabinet d'Avocats, il est trop tard, tous les morts vont se réveiller transformés en...zombies.

9)"A Long Day's Journey"

Les relations entre Cordelia et Angel sont tendues mais ils n'ont pas le temps de parler de leurs problèmes sentimentaux car ils doivent empêcher La Bête de tuer des entités supérieures qui possèdent des artefacts dont elle a besoin pour continuer de lancer son rituel. Gwen viendra donner un coup de main à Angel sur cette affaire, déclenchant un brin de jalousie chez Cordelia. Il n'y a pas que Cordy qui ressent de la jalousie, Gunn a du mal à supporter la présence de Wesley près d'eux et surtout de Fred. Tout le monde pense que Connor est en relation avec La Bête, mais Cordelia a soudain une vision qui lui fait comprendre que Connor n'y est pour rien, celui qui a une connection avec le démon n'est autre que.... Angelus.

10)"Awakening"

Suite au rituel du démon, le soleil est depuis voilé à Los Angeles laissant toutes opportunités aux vampires. Pour Wesley, un seul moyen de combattre La Bête afin de faire revenir le soleil avant qu'un effroyable massacre ne commence, il leur faut faire revenir Angelus. Bien que contre le fait de laisser ressurgir le démon cruel et vicieux qui est en lui, Angel n'a pas le choix. Wesley fait appel à un shaman afin qu'il lui ravisse son âme. Le sort est lancé après que toutes les précautions aient été prises afin de garder Angelus enfermé.

11)"Soulles"

Bien qu'Angelus soit enfermé dans la cage et donc apparemment hors d'état de nuire, ses confrontations avec chacun du groupe d'Angel Investigations font remonter à la surface tous les problèmes régnant depuis quelque temps entre eux. Pour l'inciter à les aider et à révéler ce qu'il sait sur La Bête, Cordelia passe un pacte avec lui. En échange de toutes les infos qu'il possède sur le démon, la jeune femme lui offrira un jouet dont il a très envie.... elle.

12)"Calvary"

L'âme d'Angel a disparu et personne ne sait qui l'a dérobé ni comment. Le mystère plane ainsi que le danger que représente Angelus toujours enfermé dans sa cage au sous-sol. Wesley décide d'aller voir le shaman qui leur avait permis d'extraire l'âme du vampire mais en vain. Et voilà que Lilah se présente soudain devant Angelus, bien décidée à le faire parler pour stopper et éliminer La Bête, responsable de l'anéantissement de Wolfram & Hart. De son côté Cordelia a la vision d'un sort leur permettrant de rendre son âme à Angel. Le sort semble avoir marcher jusqu'à ce que tout le groupe se rende compte qu'Angelus n'a pas récupéré son âme et que ce n'était qu'une ruse. Trop tard, Angelus se retrouve libre.

13)"Salvage"

Depuis que le soleil est voilé apportant une nuit continuelle sur Los Angeles, les vampires font régner la terreur dans les rues. A l''hôtel Hyperion, Wesley et Gunn trouvent le corps sans vie de Lilah, deux petits crocs au cou et Angelus penchée sur elle en train de boire son sang. Choqués, ils réagissent trop tard et Angelus s'enfuit à nouveau. Tout le monde est bouleversé par ce qui est arrivé, notamment Wesley qui ne peut s'empêcher de se sentir coupable de la mort de la jeune avocate. Leur priorité numéro un est donc de retrouver au plus vite Angelus afin de l'empêcher de continuer de tuer. Wersley ne voit qu'une seule personne pour y a parvenir, l'ex-Tueuse de vampires..... Faith.

14)"Release"

Faith a pris en main les opérations malgré la désapprobation de Cordelia et le rechignement de Connor à lui obéir. Sa première confrontation avec Angelus ne se passe pas vraiment comme prévu, celui-ci ayant été déjà prévenu du retour de la Tueuse Egarée. Angelus semble avor accepter la collaboration avec La Bête et Faith se fait méchamment battre comme plâtre par le démon invincible sous l'oeil goguenard d'Angelus. A l'instant où le démon est sur le point d'éliminer Faith, Angelus le tue à l'aide d'un poignard créé d'après le démon. La mort de La Bête fait revenir le soleil, ce que Angelus n'avait pas prévu. Pendant ce temps, Cordelia apprend à Connor qu'elle attend un enfant de lui et qu'ils vont dorénavant être une vraie famille.

15)"Orpheus"

Lors de leur troisième et dernière confrontation, Angelus a mordu Faith mais il s'écroule comme empoisonné avant de l'avoir tué. A son tour Faith sombre dans le coma. Wesley explique à Lorne et aux autres, qu'il avait prévu la défaite de Faith face à Angelus et qu'il avait donc monté un piège. Faith s'est injectée dans le sang une drogue magique qui a mit Angelus hors d'état de nuire mais a également plongé Faith dans un sommeil dont elle peut ne pas se réveiller. Dans son état d'inconscience, Angelus vit des flash-back du passé d'Angel à différentes périodes de sa vie. Et comble d'étrangeté Faith les vit aussi. Ce qui va également amené un face à face des plus inimaginables, Angelus contre Angel. De plus la venue d'un membre du scoobygang de Sunnydale apporte la surprise à Angel Investigations.... Willow. La jeune sorcière est venue rendre son âme à Angel.

16)"Players"

Tout le groupe est sous le choc de l'annonce de la grossesse de Cordelia. Une grossesse qui a atteint un seuil de 8 mois en quelques semaines, ce qui évidemment leur fait se poser la question de savoir si cet enfant est démoniaque ou pas. Seul Connor ne semble pas vraiment y attacher la moindre importance, manipulé comme il l'est par Cordy. Alors que Gwen de retour à Los Angeles, requiert l'aide de Gunn dans une affaire privée, tous les autres se lancent dans des recherches concernant ce "bébé" qu'attend Cordelia.

17)"Inside Out"

Angel, Lorne, Fred et Wesley ont tendu un piège à Cordelia. Ils savent enfin qu'elle est le maître de la Bête. Angel veut savoir où est la vraie Cordelia, refusant de croire que celle-ci ait pu devenir maléfique mais Cordy lui rétorque qu'il ne la connait peut-être pas aussi bien qu'il le croit. Alors que Cordelia essaie de poignarder Angel et que celui-ci n'a d'autre choix que de se défendre, débarque Connor qui juge la situation d'une façon diffiérente. Croyant que son père, par jalousie, essaie de tuer Cordelia et leur enfant, il se bat contre lui et réussit à s'enfuir avec Cordy. Afin de retrouver la jeune femme et de comprendre ce qui a bien pu se passer, Angel décide de retourner dans la dimension démoniaque dans laquelle se trouve Skip, le fameux guide de Cordelia, lui seul pourra le renseigner. Mais Skip est-il vraiment un démon du Bien ?

18)"Shiny Happy People"

Angel n'a pas pu empêcher la naissance de l'enfant de Cordelia et Connor et sous ses yeux ébahis, l'horrible démon avec des tentacules dont il s'apprêtait à tuer d'un coup d'épée, se change en une belle et rayonnante jeune femme à la peau d'ébène. Dès qu'ils la voient, Angel et Connor tombe à genoux devant elle, avec un regard émerveillé. A l'hôtel, les autres ne comprennent rien à l'attitude d'Angel et de Connor qui semblent s'être réconciliés et alors que Cordelia est dans le coma. Ils veulent savoir ce qui s'est passé mais Angel leur dit que dorénavant tout va changer car ils vont tous être sauvés.

19)"Magic Bullet"

Toute la ville de Los Angeles est sous l'emprise de Jasmine, "l'enfant" de Cordelia et de Connor. Tous les habitants ne pensent plus dorénavant qu'à s'aimer et à s'entraider et à vénérer cette divinité venue leur apporter paix et bonheur. Tout le gang d'Angel est également sous sa domination jusqu'au moment où Fred par le plus grand des hasards, se trouve en contact avec le sang de Jasmine et le véritable visage de celle-ci lui apparait. Un visage démoniaque qui la remplit d'horreur et lui fait comprendre la vérité. Pour sauver sa vie, Fred va devoir se battre seule et trouver le moyen d'annuler l'emprise de Jasmine sur les autres.

20)"Sacrifice"

Grâce à Fred, Angel et les autres ne sont plus sous l'emprise de Jasmine mais ont dû s'enfuir pour trouver refuge dans les égoûts. Tous les habitants de Los Angeles sont à leur recherche ainsi et surtout Connor qui lui, semble avoir toujours vu le vrai visage de Jasmine. Après que Wesley et Angel aient dû faire face à un horrible démon venu de la dimension démoniaque d'où vient Jasmine, ils découvrent une orbe magique qui ouvre un portail dimensionnel sur ce monde. Seul Angel peut s'y rendre afin de découvrir le moyen d'éliminer Jasmine et d'empêcher qu'elle continue à étendre son pouvoir sur le reste de la terre. Pendant ce temps, dans les égoûts, Wesley, Lorne, Fred et Gunn doivent combattre Connor et son armée qui ont trouvé leur cachette.

21)"Peace Out"

Connor et son armée ont fait prisonnier Wesley, Lorne, Fred et Gunn. Bien que Wesley essaie de lui faire entendre raison, Connor refuse d'écouter et ne leur pardonne pas ce qui est à ses yeux une "trahison" envers Jasmine. Il s'apprête à les tuer mais est stoppé à la dernière minute par Jasmine qui désire leur parler. Dans le monde démoniaque, Angel doit combattre un démon gardien d'un temple et seul capable de révéler le véritable nom de Jasmine. La révélation de son nom enlèvera à tout jamais le pouvoir de Jasmine sur les humains et leur montrera sa véritable apparence.

22)"Home"

Angel a réussi à dévoiler la véritable apparence de Jasmine à la population de Los Angeles ce qui a annulé son pouvoir sur les humains. Alors qu'Angel et Jasmine se battent, Connor survient et tue froidement Jasmine sous le regard ébahi de son père. Angel essaie de réconforter son fils mais Connor le repousse une fois de plus. De retour à l'hôtel, Angel reste stupéfait lorsqu'il trouve tout le groupe avec Lilah. Bien que décédée, l'avocate est de retour afin de leur faire une proposition des plus inimaginables, diriger à leur convenance la section à Los Angeles de Wolfram & Hart. Refusant d'abord avec conviction, Angel, Wesley, Fred, Gunn et Lorne finissent par accepter, chacun pour une raison personnelle.